Początki kultu maryjnego w Stoczku Klasztornym sięgają czasów
średniowiecza, ale są mało znane. Według legendy dwie dziewczynki
grabiące siano na łące nieopodal Stoczka znalazły w pniu starego dębu
figurkę Matki Bożej. Powodowane pobożnością, zaniosły figurkę do Stoczka. Mieszkańcy wsi ucieszyli się bardzo i postanowili wznieść kaplicę. Jednak wczesnym rankiem następnego dnia rzeźbę znaleziono przy dębie. Miejscowy proboszcz z Kiwit, gdy dowiedział się o tym, umieścił figurkę w swoim kościele. Jednak i z tego miejsca powróciła ona tam, gdzie rósł spróchniały dąb. Proboszcz pobudował przy dębie małą kaplicę, a miejsce to zaczęło być nawiedzane przez wiernych.
W klasztorze w Stoczku w latach 1952–1953 więziony był przez władze komunistyczne kardynał Stefan Wyszyński.
Tutaj właśnie przygotował akt zawierzenia Matce Bożej całej Ojczyzny. W
jednym z pomieszczeń znajduje się dziś izba pamięci, utrwalająca
obecność ks. Prymasa w tym miejscu. 19 maja 1987 roku papież Jan Paweł
II kościół Najświętszej Maryi Panny Matki Pokoju w Stoczku Klasztornym
włączył w poczet Bazylik Mniejszych.